Resumen:
Domingo Rafael Aguilar y Santillán nació en la Ciudad de México el 4 de agosto de 1863, sus padres fueron el general Bruno Aguilar y Orendain y María Concepción Santillán Miller. Se casó con Agustina González Garay el 15 de julio de 1903. Fue fundador de la Sociedad Científica “Benjamín Franklin” como alumno de secundaria del Colegio Manterola en Tacubaya y editor de la revista “La Linterna”, en colaboración con Rafael de Alva y Gómez, y Daniel y Joaquín Vélez. José Pánfilo Ramón Manterola (1845-1914), fundador de esa escuela fue una importante influencia pues le mostró la relevancia de las ciencias y las bibliotecas. Después ingresó a la Escuela Nacional Preparatoria, localizada en el Antiguo Colegio de San Ildefonso, en donde fundó a los 20 años en 1884 la Sociedad Científica “Antonio Álzate” junto con Manuel Marroquín y Rivera, Ricardo Cicero, Guillermo Beltrán y Puga, Agapito Solórzano y Daniel M. Vélez, con el objetivo de cultivar las ciencias exactas, físicas, naturales y sociales en todas sus ramas y aplicaciones. Más tarde por medio del Gobierno de la República el 14 de octubre de 1930, obtendría la categoría de Academia Nacional de Ciencias “Antonio Álzate”, misma que desapareció en 1964.
Visitó los Estados Unidos y Francia en 1888 y 1889 en compañía de su padre Bruno Aguilar para estudiar Geología, Mineralogía y Petrografía, sus profesores fueron Ferdinand André Fouqué y Alfred Lacroix en el Colegio de Francia y de Albert de Lapparent en el Instituto Católico de París. Más tarde, el ingeniero José G. Aguilera Serrano, entonces director del Instituto Geológico de México, lo designó Secretario y Bibliotecario de esa institución, cargo que ocupó desde julio de 1902 hasta octubre de 1915. En ese mismo año organizó y catalogó la Biblioteca Pública de la Secretaría de Agricultura y Fomento, ubicada en el antiguo templo de Betlemitas, donde fue Jefe del Departamento. Años más tarde, como recompensa de sus trabajos, el gobierno federal le concedió una pensión vitalicia que le permitió dedicarse por completo a la Sociedad Científica “Antonio Álzate”. Como docente fue Preparador de Física y Química en la Escuela Nacional para Profesores de 1892 a 1909, y profesor de Mineralogía y de Geología. De 1895 a 1902 fue Preparador de Historia Natural en el Colegio Militar. De 1909 a 1915 dio la clase de Mineralogía y Geología en el Museo Nacional de Historia Natural. Asimismo, ocupó el puesto de vocal de la Comisión de Publicaciones de la Secretaría de Fomento de 1905 a 1906; fue miembro de la Comisión de Organización y Secretario de los Congresos Meteorológicos Nacionales en 1900 y 1902; miembro de la Comisión de Organización y uno de los Secretarios del Décimo Congreso Geológico Internacional, reunido en México en septiembre de 1909 y Secretario General del Primer Congreso Científico Mexicano que celebró la Sociedad Científica “Antonio Álzate” en 1912. La Sociedad Científica Antonio Álzate celebró sus Bodas de Plata por su 25 aniversario en 1909, por lo que se le otorgó una medalla de oro y se le rindió un homenaje por parte de la Sociedad Mexicana de Geografía y Estadística, de la que fue vicepresidente en 1919, por elaborar el Índice General de los 32 tomos del Boletín y por la Cartografía Mexicana que formó y que continuó Manuel Orozco y Berra. Fue socio fundador del Instituto Bibliográfico Mexicano en 1899 y de la Sociedad Geológica Mexicana en 1904. La Universidad Nacional le otorgó el grado de Doctor Honoris Causa el 26 de noviembre de 1934 durante la rectoría del doctor Fernando Ocaranza que le fue concedido de manos del director del Instituto de Geología, ingeniero Manuel Santillán. El licenciado Ignacio García Téllez, primer Rector de la Universidad Nacional Autónoma de México, le otorgó en 1932 un diploma que lo acreditó como colaborador honorario del instituto. De las numerosas corporaciones científicas tanto nacionales como extranjeras de las cuales fue miembro podemos mencionar: Instituto Geográfico Argentino, Sociedad Científica Argentina, Oficial de Instrucción Pública en Francia, Instituto Ibero- Americano de Hamburgo, Universidad de Wurzburgo, Instituto Geológico de México, Sociedad Mexicana Geográfica y Estadística, American Geographical Society of New York, sociedades geográficas de Berlín, Chicago, La Habana, Lima y Varsovia, Société Nationale des Sciences Mathématiques et Naturelles de Cherbourg, Société Géologique de France, Sociedad Geológica Mexicana, American Library Association, Société des Américanistes, entre otras.
Su aportación en el estudio y enseñanza de las ciencias, en la conformación de colecciones bibliográficas y su organización, así como la realización de bibliografías especializadas, califican a Rafael Aguilar y Santillán como uno de los fundadores de la bibliotecología mexicana y un impulsor incansable del intercambio de conocimiento de México con el mundo. La biblioteca de la sociedad que fundó alcanzó más de tres millones de objetos en sus colecciones. Tras muchos años de abandono, los impresos y documentos sobrevivientes se encuentran en su mayoría en el Acervo Histórico del Palacio de Minería
Aguilar falleció el 27 de febrero de 1940 a los 77 años, en su domicilio localizado en Morelia 99, colonia Roma, Ciudad de México. Entre sus obras destacan La Bibliografía Geológico y Minera de la República Mexicana en tres entregas: Hasta 1904 (1908), de 1905 a 1918 (1918) y de 1919 a 1930 (1936); Reseñas Relativas al Establecimiento y Trabajos de la Sociedad Álzate, 1885-1886; El Ozono, 1887; Apuntes para el Estudio de las Lluvias en México, 1888; Apuntes Relativos a Algunos Observatorios e Institutos Meteorológicos Visitados en Europa, 1889; Bibliografía Meteorológica Mexicana, 1890-1896; Índice General de los Tomos 1 al 27 de las Memorias y Revistas de la Sociedad Científica “Antonio Álzate 1909, Documentos Relativos al Estado de la Sociedad Álzate hasta el 30 de junio de 1902; Índice General del Boletín de la Sociedad Mexicana y Estadística, 1918. Fue editor de las Memorias y Revista de la Sociedad Científica “Antonio Álzate”.